我有几个不同长度的序列。例如,
Seq1 -- "A", "B", "A", "A", "K", "L", "C", "B","C", "D"
Seq2 -- "A", "C", "A", "D", "C", "A", "K", "D"
Seq3 -- "B", "C", "A", "A", "B", "K", "A", "D", "L", "A", "B","C","D"
.................................
......................................
Seq40 - "C","D", "A", "A", "D", "B", "K", "K", "C","D"
我想使用 HMM 对这些序列进行聚类。我的想法是根据它们的隐藏状态对它们进行聚类。有没有使用 HMM 对序列进行聚类的标准方法?另外,我知道在 python、hmmlearn 和 R 中,seqHMM 包很好。我怎样才能适应这些序列来聚类它们?