我看到这个问题得到了投票，所以其他人正在寻找答案。这里是：

当我这样做时，我以 Ubuntu 实例上的默认用户身份登录

$s3cmd get s3://data-analysis/input-data/filename.csv

数据从 s3 存储桶保存到名为 ubuntu 的用户的主目录中。这可以通过以下方式验证：

$ df -h /home/ubuntu/

因为我遵循了randy zwitch关于在aws上安装R的教程——我创建了一个名为rstudio的用户，这是我用来登录rstudio服务器的用户名。因此，我不得不将文件从默认的“ubuntu”用户的主目录移动到用户“rstudio”。这可以通过以下方式完成：

$ sudo mv /home/ubuntu/filename.csv /home/rstudio

很高兴回答后续问题。