这个问题问得好。首先让我们验证您的公式是否正确。您提供的信息对应于以下因果模型:

正如你所说,我们可以推导出P(Y|do(X))使用do-calculus的规则。在 R 中,我们可以使用 package 轻松做到这一点causaleffect
。我们首先加载igraph
以使用您提出的因果图创建一个对象:
library(igraph)
g <- graph.formula(X-+Y, Y-+X, X-+Z-+Y, W-+X, W-+Z, W-+Y, simplify = FALSE)
g <- set.edge.attribute(graph = g, name = "description", index = 1:2, value = "U")
其中前两项X-+Y, Y-+X
代表未观察到的混杂因素X和Y其余术语代表您提到的有向边。
然后我们要求我们的估计:
library(causaleffect)
cat(causal.effect("Y", "X", G = g, primes = TRUE, simp = T, expr = TRUE))
∑W,Z(∑X′P(Y|W,X′,Z)P(X′|W))P(Z|W,X)P(W)
这确实与您的公式不谋而合——带有观察到的混杂因素的前门案例。
现在让我们进入估计部分。如果您假设线性(和正态性),事情就会大大简化。基本上你想要做的是估计路径的系数X→Z→Y.
让我们模拟一些数据:
set.seed(1)
n <- 1e3
u <- rnorm(n) # y -> x unobserved confounder
w <- rnorm(n)
x <- w + u + rnorm(n)
z <- 3*x + 5*w + rnorm(n)
y <- 7*z + 11*w + 13*u + rnorm(n)
注意在我们的模拟中,变化的真实因果效应X在Y是 21。您可以通过运行两个回归来估计这一点。第一的 Y∼Z+W+X获得效果Z在Y进而Z∼X+W获得效果X在Z. 您的估计将是两个系数的乘积:
yz_model <- lm(y ~ z + w + x)
zx_model <- lm(z ~ x + w)
yz <- coef(yz_model)[2]
zx <- coef(zx_model)[2]
effect <- zx*yz
effect
x
21.37626
并且为了推断,您可以计算产品的(渐近)标准误差:
se_yz <- coef(summary(yz_model))[2, 2]
se_zx <- coef(summary(zx_model))[2, 2]
se <- sqrt(yz^2*se_zx^2 + zx^2*se_yz^2)
您可以将其用于测试或置信区间:
c(effect - 1.96*se, effect + 1.96*se) # 95% CI
x x
19.66441 23.08811
您还可以执行(非/半)参数估计,稍后我将尝试更新此答案,包括其他程序。