均值比 - 使用 Fieller 定理的统计比较测试?

机器算法验证 假设检验 统计学意义 置信区间 p 值 部分
2022-03-15 14:03:46

对于以下数据分析问题,我将不胜感激。请阅读到最后,因为问题起初可能看起来微不足道,但经过大量研究,我向您保证不是。情况有点复杂,因为我想比较均值的比率:

例如,在一个实验中,我从 7-8 个表达特定离子通道基因 (Gene1) 的细胞(复制品)中收集了数据(电流水平,一个连续变量)。这给了我一个 Gene1 的平均电流水平。然后我测量了一组不同的 7-8 个复制细胞的电流水平,这些细胞也表达 Gene1 PLUS 激活基因(“治疗”)。现在我有一个 Gene1+activator 的平均电流值。

我对 Gene2(不同的离子通道基因)重复两次测量,再次记录 7-8 次细胞复制的平均电流值,仅用于 Gene2,然后用于 Gene2+激活剂。

我有兴趣比较的数量是 Gene1 与 Gene2 的激活剂引起的激活百分比或激活倍数。因此,我将通过将 Gene1+激活剂的平均电流除以单独的 Gene1 的平均电流来获得一个比率。这会给我 Gene1 的折叠激活。我会将其与为 Gene2 获得的类似比率进行比较。

我已经对此进行了一些研究,并且使用Fieller 的区间来计算误差线或置信区间似乎很有希望。但是,我不知道如何将其转换为假设检验并获得适当的 p 值来比较均值相同/不同。此外,最好的解决方案还允许多重比较,并允许我同时比较 Gene1 和 Gene2 以及 Gene3 和 Gene4 的“折叠激活”。

Fieller 的区间似乎是计算每个折叠激活的 95% 置信区间等的完美工具,但是当我们提交给期刊时,他们会坚持使用 p 值进行比较。到目前为止,我只能坚持认为没有 CI 重叠显然表明存在显着差异,但我知道没有 95% CI 重叠是一个过于严格的比较测试,它表示 alpha<0.05。我真的很感激对适当比较测试的任何建议(单项或多项比较,在这一点上都会有所帮助)。提前致谢。

1个回答

虽然一般的解决方案可能很困难,但对于这种情况,如果以对数尺度进行分析,则解决方案很简单。我会争辩说,即使没有比较比率,在对数尺度上工作对于这种类型的数据也是有意义的。

仅当所有离子电流具有相同符号(全部向内或全部向外相对于细胞)时,所描述的实验和所需比较才有意义。此外,这些类型的测量中的误差通常与被测量的值成比例,而不是独立于这些值。因此,在电流(绝对值)的对数范围内工作是有意义的。

如果I代表当前,1 和 2 代表基因,和ca分别代表控制和激活案例,所需的比较是I1a/I1c相对I2a/I2c. 在对数尺度中,原假设变为:

log(I1a)log(I1c)=log(I2a)log(I2c)

这可以通过在这个对数尺度的标准线性模型中检查基因和激活剂之间的相互作用来测试。这种方法的优点是易于扩展到多个基因(和激活剂)。

我想人们可以想象在对数尺度下工作不合适的情况,但是对于实践中生物医学实验中的这种类型的比较,对数转换通常在测量什么方面是有意义的,并且避免了这里提到的应用 Fieller 间隔的麻烦.