我知道第二个特定于网络流量，但除此之外，两者之间有什么区别吗？

不。

jhead@R1# set firewall ?
Possible completions:
> filter               Define an IPv4 firewall filter

包含 IPv4（协议族 inet）。

jhead@R1# set firewall family ?
Possible completions:
> inet                 Protocol family IPv4 for firewall filter

还包含 IPv4（协议族 inet）。

如果不是，为什么有两种不同的方式在 MX 路由器上编写防火墙规则？

旧版本的 JUNOS 过去只有"set firewall filter"，新版本也包含"set firewall family"。因此决定它应该保留给那些不需要指定除 IPv4 (inet) 以外的家族的人。

它似乎有点倒退，但如果您还没有，我建议坚持一种风格，以尽可能保持配置清晰。