我有一个带有用户连接的数据集,我想创建一个有向网络图。
节点:~20.000 边:~33.000
我以前在 NodeXL 和 Gephi 上工作,但现在我在 Mac 上,我无法访问 NodeXL。
我尝试了 Gephi 和另一个名为 Cytoscape 的工具。他们俩都落后了,我几乎无法做一些统计。可视化图表是一个梦想。
有没有可以处理这么大的网络图的软件(或者 Python 库)?
我有一个带有用户连接的数据集,我想创建一个有向网络图。
节点:~20.000 边:~33.000
我以前在 NodeXL 和 Gephi 上工作,但现在我在 Mac 上,我无法访问 NodeXL。
我尝试了 Gephi 和另一个名为 Cytoscape 的工具。他们俩都落后了,我几乎无法做一些统计。可视化图表是一个梦想。
有没有可以处理这么大的网络图的软件(或者 Python 库)?
有!
如果你有一台好机器,我认为在 Networkx 上 20k-30k 节点边缘就可以了!Networkx 是 Python 中的一个很棒的库,特别是用于图形分析,因此除了可视化之外,您还可以使用强大的分析工具,但是可视化 20k 顶点需要大量 RAM 并且需要很长时间。
Igraph 是另一个使用 Python、R 和 C 中的 API 进行图形分析的出色工具。您可以使用 Igraph 库做很多事情,包括漂亮的绘图工具。
SNAP 是由斯坦福大学的 Jure Leskovec 和他的同事开发的。一个大规模的图形处理库,原生用 C 语言编写,带有 Python 中的 API。这个库可以在一台个人机器上处理巨大的图表。
Mathematica 可以绘制 2D ( GraphPlot ) 和 3D ( GraphPlot3D ) 图(静态和交互式),并且有许多选项可用于微调显示和交互式内容。有一个非常详细的图形绘图语言概述,其中包含教程和示例。
StackOverflow 已经回答了这个问题。可视化具有一百万个顶点的图 。我建议使用 Graphexp 进行可视化,并将 JanusGraph 作为后端存储