我不会只关注“深度学习”，除非你有特定的理由这样做。可能有其他技术可以同样有效或更有效。

我见过用于类似事情的一种方法是Inductive Logic Programming。有关使用 ILP 推理生物化学元素的一个示例，请参阅本文

这并不完全是关于检测疾病，但它确实说明了使用 ILP 推理涉及生物化学中代谢途径的状态和反应的广泛概念。基本思想可能更适用于检测疾病。