我认为这个问题对于一个完整的答案来说太笼统了，因为后者将完全取决于你在模拟什么以及你对什么感兴趣。唯一想到的是

• 在计算动态可观测量（例如均方位移或中间散射函数）时，请记住使用相对速度（相对于系统的质心）。
• 径向分布函数仅在以下情况下才有意义$r = L/2$， 在哪里$L$是盒子的侧面。
• 如果系统结晶，请注意您可能需要 NPT（即恒压）模拟才能获得有意义的结果。
• 非常接近临界点（或其他一些过渡/交叉点，例如渗流线），一些量变得严重依赖于大小，这意味着您需要对系统大小进行一些外推以获得“真实”值。