我的想法是，通过将 VLAN 1002 和 2002 放在该接入交换机上的不同 MSTP 实例中，它的工作方式与 PVSTP 相同（这两个端口上都没有其他 VLAN）。

这就是 MSTP 实例的工作方式。但是，所有交换机都需要位于同一区域，并且具有完全相同的配置。（检查配置摘要。）默认情况下，每个 VLAN 都在公共实例中。（IST/CIST/instance 0/无论你的交换机如何称呼它）只有一个实例，MSTP 的行为就像 (R)STP。对于多个实例，应修剪 VLAN，而不是阻止整个链路，但要对优先级/等进行一些调整。可能是必要的。

最后的手段可能是简单地关闭这两个端口上的 STP。但这又是一团糟。

MSTP 中的一个重要概念是 MSTP区域，它是一组直接连接的具有相同配置（摘要）的 MSTP 交换机。MSTP 规则仅适用于区域和区域内链路。区域间链路完全向后兼容 RSTP。

如果您只运行一个 MSTP 交换机，则 MSTP 规则适用于恰好零个链路。您总是在浪费时间在一台交换机上配置多个 MSTP 实例。

RSTP，显然只会阻塞此处的一个端口，因此在 RSTP 重新收敛之前不会出现第二个 OSPF 邻接

使用 RSTP，其中一个链接将始终被阻止。RSTP 完全与 VLAN 无关。

通过将 VLAN 1002 和 2002 放在该接入交换机上的不同 MSTP 实例中，它的工作方式与使用 PVSTP 相同

不是自己。使用 MSTP，您需要在每个实例中使用不同的根网桥来获得不同的生成树，或者使用不同的端口优先级将活动链路移动到另一个端口对。请注意，RPVST+ 还需要调整以针对不同的 VLAN 使用不同的链路。

RSTP 交换机不会在每个端口上看到不同的 BPDU，并且 MSTP 交换机将来自 RSTP 交换机的 BPDU 保存在单独的生成树中吗？

RSTP 只与 MSTP 公共实例互通。

在一台交换机上运行两个 MSTP 实例，在另一台交换机上运行 RSTP 是否不起作用？

共同点是RSTP，它总是阻塞（除了）一个链接。

将 VLAN 添加到它们各自的 MSTP 实例后，它们所在的端口仍然驻留在 CIST 中，但我似乎找不到删除它们的方法

正如 Ricky 已经指出的那样，MSTP 实例需要在所有区域交换机上进行相同的配置才能工作。很可能，有一个对 RSTP 的回退，请检查日志。

由于您似乎只是为了获得路由链接而运行这些 VLAN，因此您应该考虑关闭这些端口上的 MSTP/RSTP。如果交换机允许，路由端口也可以工作，因为它们不参与 xSTP。

MSTP 实例可以工作，但双方都需要 MSTP。仅限于 RSTP，您无能为力。

(LACP) LAG 也可以在两个交换机之间工作，但它会通过每个物理链路连接每个 VLAN，从而消除您对物理分布的控制。