我正在寻找一个合适的图形表示，其中节点/顶点是具有 2 个主要变量的分子：结构特征和实数属性（例如生物效力）。该网络是由分子通过匹配结构特性构建的，并且它可能相当复杂，具有许多高度顶点簇（即结构上彼此相似的分子）。然而，表示应该给出一个清晰的图像，尽管不需要高细节精度：某种分类就足够了。我与 JUNG 一起玩了一个图形，该图形具有边权重作为效力的变化，而 ISOM 布局认为它保留（尽可能多）边权重但效果不佳。像径向布局这样的东西可能是理想的，因为它可以清楚地显示效力分布，但这显然会受到靠近中心的顶点拥挤的影响。显然，我的知识受到限制，您是否会建议一些布局并且对于非专家实施是否实用？