这篇关于 Adaboost的论文给出了一些建议和代码(第 17 页),用于将 2 类模型扩展到 K 类问题。我想概括这段代码,以便我可以轻松插入不同的 2 类模型并比较结果。因为大多数分类模型都有公式接口和predict
方法,所以其中一些应该相对容易。不幸的是,我还没有找到从 2 类模型中提取类概率的标准方法,因此每个模型都需要一些自定义代码。
这是我编写的一个函数,用于将 K 类问题分解为 2 类问题,并返回 K 个模型:
oneVsAll <- function(X,Y,FUN,...) {
models <- lapply(unique(Y), function(x) {
name <- as.character(x)
.Target <- factor(ifelse(Y==name,name,'other'), levels=c(name, 'other'))
dat <- data.frame(.Target, X)
model <- FUN(.Target~., data=dat, ...)
return(model)
})
names(models) <- unique(Y)
info <- list(X=X, Y=Y, classes=unique(Y))
out <- list(models=models, info=info)
class(out) <- 'oneVsAll'
return(out)
}
这是我编写的一种预测方法,用于迭代每个模型并进行预测:
predict.oneVsAll <- function(object, newX=object$info$X, ...) {
stopifnot(class(object)=='oneVsAll')
lapply(object$models, function(x) {
predict(x, newX, ...)
})
}
data.frame
最后,这是一个对预测概率进行归一化并对案例进行分类的函数。请注意,您可以data.frame
从每个模型中构建概率的 K 列,因为没有统一的方法从 2 类模型中提取类概率:
classify <- function(dat) {
out <- dat/rowSums(dat)
out$Class <- apply(dat, 1, function(x) names(dat)[which.max(x)])
out
}
这是一个使用示例adaboost
:
library(ada)
library(caret)
X <- iris[,-5]
Y <- iris[,5]
myModels <- oneVsAll(X, Y, ada)
preds <- predict(myModels, X, type='probs')
preds <- data.frame(lapply(preds, function(x) x[,2])) #Make a data.frame of probs
preds <- classify(preds)
>confusionMatrix(preds$Class, Y)
Confusion Matrix and Statistics
Reference
Prediction setosa versicolor virginica
setosa 50 0 0
versicolor 0 47 2
virginica 0 3 48
这是一个使用示例lda
(我知道 lda 可以处理多个类,但这只是一个示例):
library(MASS)
myModels <- oneVsAll(X, Y, lda)
preds <- predict(myModels, X)
preds <- data.frame(lapply(preds, function(x) x[[2]][,1])) #Make a data.frame of probs
preds <- classify(preds)
>confusionMatrix(preds$Class, Y)
Confusion Matrix and Statistics
Reference
Prediction setosa versicolor virginica
setosa 50 0 0
versicolor 0 39 5
virginica 0 11 45
这些函数应该适用于任何具有公式接口和predict
方法的 2 类模型。注意,你必须手动拆分X和Y分量,这有点难看,但现在写一个公式界面已经超出了我的范围。
这种方法对每个人都有意义吗?有什么办法可以改进它,或者是否有现有的软件包可以解决这个问题?