我正在尝试报告我们在 R 中拟合的线性混合模型的效果大小。现在我正在研究报告部分 eta 平方或 eta 平方。但是，为此我需要计算平方误差之和。我们正在使用该lme()函数，它不报告 MSE 或效果大小。我不是进行主要分析的人，所以我不知道我们是否可以切换到使用ez包，如Omega squared for measure of effect in R 中所述？.

lmeObject函数返回的有lme()一些信息，但我不确定哪个最合适。在 上使用anova()时lmeObject，它将 F 检验的分母自由度报告为 56683，因此使用 MSE 的值，我可以计算 SSE 并对 F 检验进行逆向工程，以获得部分 eta 平方所需的 SS 处理。我有 2 个固定效应和一个随机效应（用于重复测量设计）。

我已经查看lmeObject$sigma并计算了 的平方和lmeObject$residuals[,1]，但他们不同意（我sigma将 SS 除以自由度）。

那里有任何 R 大师可以告诉如何从 计算 MSE 或 SSE lmeObject？