我熟悉线性回归模型,但线性混合模型的随机部分让我大吃一惊。我确实找到了一个可以帮助我的优秀指南,但是 languageR 包与新版本的 lme4 不兼容,所以我无法在我的工作中实现它。
对我来说,固定效应是很容易理解的(低于哺乳期和更高的 yr2 值都有助于增加体重,但哺乳期效应更一致,从而导致更高的 t 值)。
第一个问题是要了解我实际输入的内容。在一定程度上我理解这(1|P$grupp)
意味着混合模型添加到基线(截距)而(P$grupp|P$lweek)
意味着属于一个组预计会影响平均体重增加(或减少)同时P$lweek
增加基线值。但是为什么所有的教程似乎都倾向于像(1+P$fgrupp|P$lweek)
而不是像这样的文章(P$grupp|P$lweek)
呢?
现在进入实际输出(完整输出见下文)。我使用了以下模型(对不起,Swenglish,但样本是奶牛P$vikt
的重量是特定时间点的体重,P$lweek
是小牛出生后的时间,P$fgrupp
是判断奶牛是否属于饲料组 1 的因素, 2 或 3):
Formula: P$vikt ~ P$lweek + P$laktation + P$yr + (1 | P$fgrupp) #$
Formula: P$vikt ~ P$lweek + P$laktation + P$yr + (1 + P$fgrupp | P$lweek)
我将其理解为第一个相当无用(本质上它告诉我们奶牛的平均体重也不受它属于哪个饲料组的影响)。这反映在 fgrupp 在下面的第一个公式中具有方差 0。第二个更有趣,P$fgrupp|P$lweek
因为据我了解,它应该显示不同的饲料组是否会随着时间的推移影响奶牛的体重增加。但我真的没有足够的能力来理解输入。我理解方差在某种程度上意味着属于第 2 组或第 3 组解释了增长曲线中的一些变化,但我真的不明白如何解释这一点。
Random effects:
Groups Name Variance Std.Dev. Corr
P$lweek (Intercept) 13.068 3.6149 #$
P$fgrupp2 77.230 8.7881 1.000 #$
P$fgrupp3 81.188 9.0104 1.000 1.000 #$
Residual 4031.831 63.4967
Number of obs: 1048, groups: P$lweek, 84
全输出
#First model#
Linear mixed model fit by REML
Formula: P$vikt ~ P$lweek + P$laktation + P$yr + (1 | P$fgrupp) #$
AIC BIC logLik deviance REMLdev
11703 11732 -5845 11698 11691
Random effects:
Groups Name Variance Std.Dev.
P$fgrupp (Intercept) 0.0 0.000 #$
Residual 4139.9 64.342
Number of obs: 1048, groups: P$fgrupp, 3 #$
Fixed effects:
Estimate Std. Error t value
(Intercept) 509.593 4.683 108.82
P$lweek 1.028 0.105 9.79 #$
P$laktation 22.789 1.454 15.67 #$
P$yr2 35.294 4.093 8.62 #$
Correlation of Fixed Effects:
(Intr) P$lwek P$lktt #$
P$lweek -0.560 #$
P$laktation -0.636 0.030 #$
P$yr2 -0.240 -0.034 -0.141 #$
#Second model#
Linear mixed model fit by REML
Formula: P$vikt ~ P$lweek + P$laktation + P$yr + (1 + P$fgrupp | P$lweek) #$
AIC BIC logLik deviance REMLdev
11707 11761 -5842 11693 11685
Random effects:
Groups Name Variance Std.Dev. Corr
P$lweek (Intercept) 13.068 3.6149 #$
P$fgrupp2 77.230 8.7881 1.000 #$
P$fgrupp3 81.188 9.0104 1.000 1.000 #$
Residual 4031.831 63.4967
Number of obs: 1048, groups: P$lweek, 84 #$
Fixed effects:
Estimate Std. Error t value
(Intercept) 508.2291 5.1770 98.17
P$lweek 1.0662 0.1192 8.94 #$
P$laktation 22.6525 1.4459 15.67 #$
P$yr2 35.6343 4.0848 8.72 #$
Correlation of Fixed Effects:
(Intr) P$lwek P$lktt #$$
P$lweek -0.627 #$
P$laktation -0.570 0.025 #$
P$yr2 -0.224 -0.018 -0.136 #$