我想知道，R 或 Python 中有哪些可用的库来进行相关矩阵聚类（有时称为聚类）。

我也想知道，在对每个点进行聚类/分组之后。以相似数据位于一起的方式重建和排序矩阵的最有效和最快速（不再挖掘节点对）的方法是什么。

为了更详细地解释这一点，例如有一个相似度矩阵 n*n 和聚类方法，已返回 1,2,3 作为每个 n 标签的标签。重新排序这个 n*n 矩阵，使得所有标签为 1 的节点都在一起并且对于 2,3 相同，特别是当矩阵很大时具有挑战性。

这是分组过程的一个很好的例子http://bost.ocks.org/mike/miserables/。