小时间序列的平均偏差和标准偏差的数据可视化

机器算法验证 r 时间序列 数据可视化 多类
2022-04-17 19:53:51

我正在尝试找到可视化以下数据的最佳方法：

我有 3 个不同时间/日期的值，每个时间/日期都有相同的 20 个物种。对于每个物种，我都有平均高度和标准偏差（从 n 次观察中获得）。我没有从中获得平均值和标准偏差的观察结果。

这就是数据的样子。物种从 1 到 20 编号。

t1 = cbind(seq(1,20,1),runif(20,0.5,5.0),runif(20,0,1.0))
t2 = cbind(seq(1,20,1),runif(20,0.9,6.0),runif(20,0.2,1.5))
t3 = cbind(seq(1,20,1),runif(20,0.1,8.5),runif(20,0.4,1.0))

任何人都可以就什么是最好的情节/图形提供任何建议吗？我想及时显示平均值和标准差的演变，但是我不想做线图，对于热图，我有一个小数据集。

2个回答

你的意思是你不想要这样的线图？:)

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对于 X 轴和线图来说，时间是很自然的。这是使用小倍数方法的更好视图。

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有时它有助于通过一些分析来订购面板。这是一个按平均标准排序的示例：

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有这么多类别级别 (20)，另一种技术是将相似级别聚类并将它们叠加在一起。这是一个包含 4 个集群的示例。（不为明显但可解决的着色和标签缺陷烦恼。）

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为什么不是线图？如果您想显示平均值和 SD 的一般趋势，则线图似乎非常合适，前提是单个物种不是焦点。

无论如何，这是一个替代方案，严格来说仍然是线图，但时间不是轴之一。它也有利于讨论个别物种。x 轴是你的变量 1（我猜这是意思），y 轴是变量 2（SD）。

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是的，热图可能太多了，但我认为如果您也可以提供实际数据，则值得尝试显示 3D 内核密度。代码取自这个线程。

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另一种可能性是制作三个图：

  1. t1 SD 与平均值，使用黑色符号
  2. t1 SD 与平均值，但这次符号变为浅灰色；覆盖 t2 SD 与平均值，使用黑色符号。用箭头连接每个物种对。
  3. t2 SD 与平均值，但这次符号变为浅灰色；覆盖 t3 SD 与平均值，使用符号。用箭头连接每个物种对。
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