生物进化和人工进化的工作原理几乎相同。

适应性和选择：在生物学中，生态系统中最适合的生物更有可能存活足够长的时间来繁殖，并在此过程中传递它们的基因。在人工进化中，我们的生物实际上是我们问题的解决方案，可以对其进行评估以确定它们的好坏（它们的适应度）。我们自己选择将选择哪些解决方案进行复制（有很多方法可以进行这种选择，但所有这些方法的共同点是最适合的解决方案有更高的机会被选中）。

交叉：在生物学中，一个有机体继承了父母双方基因的一部分，父母双方的基因杂交也是如此。对于人工进化，一个新的解决方案（“子”解决方案）将继承其父解决方案的部分解决方案（我们从每个父解决方案获取部分解决方案，并将这些部分解决方案粘合在一起以构造一个新解决方案）。

突变：在自然界中，突变经常发生在出生时，这就是为什么有许多不同的物种。有害突变使个体不太可能存活足够长的时间以将它们传给孩子，相反，有益的突变使个体更有可能存活足够长的时间以将它们传给孩子。人工进化也是如此：突变随机改变了解决方案的一小部分，如果它使该解决方案更适合，那么该解决方案就有更高的机会被选择用于繁殖。

Phillipe 的出色回答涵盖了该主题的症结所在，所以我只想说明显而易见的：关键区别在于媒介和时间尺度。

生物进化是自然界的一种功能，通常会在很长一段时间内发生，这取决于生物体及其产生新世代的速度。（我们通常认为生物进化发生在“数百万年”内，但它可能发生得更快，例如在微生物的情况下。）

通用算法利用计算介质，在当前时代是基于硅的，涉及微处理器和各种内存介质（磁带和最近的固态）。

自然进化和人工进化都受到系统大小的限制（前者是行星或生态系统，后者是可用内存。）但是：

• 取决于可用的处理资源，人工进化可以以人为加速的速度发生。

这种计算“加速主观时间”和加速算法进化的能力是“技术奇点”理论的基础。

有人可能会争辩说，基因工程允许生物物种加速进化，但这不属于自然进化。