我在 stackoverflow 上问了这个问题,并为此受到了抨击。我目前正在使用我的大学使用的用 C 语言编写的遗留 MD 代码,并且还没有迁移到像 OpenMM 或 mdcore 这样的更现代的库(尽管我非常想这样做)。现在,我们的可视化程序已经过时了,我开始需要更高级的东西来制作我的模拟电影。
我们使用的当前可视化“库”是通过“glew”组合 OpenGL 基元,它是 X 扩展。我经常合作的研究人员负责可视化例程,但这是我的问题:
是否有一个更新的、“易于使用”的可视化库,我可以链接到人们可以推荐的?我真的需要它来显示 3D 模拟电影,并且能够改变视角、显示多个视角等,这将是很棒的。后处理也很好,因为我写出了包含模拟中所有对象的位置信息的二进制文件。其他人在分子动力学模拟中使用什么,而您拥有的不仅仅是球体?在当前的化身中,我有球体、圆柱体、波浪线等。