用于 MD 模拟的 Beowulf 集群

计算科学 分子动力学 高性能计算
2021-11-30 14:14:33

作为 Beowulf 集群的多合一集群管理软件,您会推荐什么?我们的研究组大约有 7 个(其中大多数是 8 核机器,1 个是 48 核机器)非常好的计算节点,它们目前使用 Rocks 管理并运行 Centos 6。我们一直在做基于 MPI 的计算,特别是,分子模拟(分子动力学和蒙特卡罗模拟)可靠,但我们现在想更新软件。我想进行系统升级会破坏软件包并重新安装集群是一个更好的选择。我想知道我们是否应该再次使用 Rocks 或寻求其他的多合一解决方案。我们想要一些易于维护的东西(我们都有 linux 方面的经验,但没有服务器管理经验)并且有 LTS。

所以,我的问题是: 1. 有没有像 PelicanHPC 这样的基于 Debian 的选项适合长期部署?2. 从头构建一个基于 Debian/Ubuntu/Centos 7 的 beowulf 集群是个好主意吗?

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