我正在注释人类基因组区域中的蛋白质编码基因,并正在寻找一组组装的 EST,我可以将其用作构建基因模型的证据。快速搜索 NCBI 的 SRA 显示了 4,318 个人类 RNA-seq 数据集,所以我知道不乏数据。但是,我希望节省搜索大量数据、选择适当的子集并自己组装 EST 所需的时间。我确信这已经做过很多次了,对于这个特定的任务,重复这个过程是没有意义的。
是否有任何可用于智人的通用(即非组织特异性)参考 EST/转录组组装?
我正在注释人类基因组区域中的蛋白质编码基因,并正在寻找一组组装的 EST,我可以将其用作构建基因模型的证据。快速搜索 NCBI 的 SRA 显示了 4,318 个人类 RNA-seq 数据集,所以我知道不乏数据。但是,我希望节省搜索大量数据、选择适当的子集并自己组装 EST 所需的时间。我确信这已经做过很多次了,对于这个特定的任务,重复这个过程是没有意义的。
是否有任何可用于智人的通用(即非组织特异性)参考 EST/转录组组装?