我一直有这个问题，我刚刚找到了一个解决方案，即使我正在谈论移动工具的人让我真正弄清楚了这个问题。

对齐工具会选择您单击的最顶层，无论您选择了哪个图层/透明度。尝试隐藏您要处理的图层上方的图层，或将其移动到顶部，使用该工具，然后将其向下移动。

我个人发现对齐工具非常不直观。我无法重现您的场景，对于您描述的行为，我唯一能想象的是您的目标图层是否有很多透明细节，并且很难点击它（比如在带有小字体文本的图层中） ）。但是，反复点击图层位置可以解决这个问题 - 所以我不认为这是你的情况。

否则，您所描述的只是程序中的一个错误，应该在http://bugzilla.gnome.org工具上报告，以便 GIMP 开发人员可以了解它并在即将发布的版本中修复。

但是，如果您详细说明该工具的用例，我可以尝试提出一个对您现在有用的脚本，除了对齐工具。这样的脚本需要在图层对话框中选择图层，而不是直接在画布上，但它会起作用。

在 Gimp 2.8 中，当您使用对齐工具并尝试单击图层组中的图层时，会选择整个图像而不是单击图层。可能在实现图层组功能时，这个细节被遗忘了。

作为一种临时解决方法，将您的图层移出图层组，对齐它们，然后将它们移回图层组中。

这在 2.8.22 中仍未修复。我终于设法通过对齐顶部的一层，隐藏它，然后向下做下一层来对齐我的所有层。如果你有很多层（幸运的是我只有 6 个），这是一个非常乏味的过程，但至少我完成了。