不能代表自然，但这里有一些我知道的工作流程：

• 使用 Illustrator 的图表工具重新创建图表。工作很辛苦，也很令人沮丧，因为 Adob​​e 自青铜时代以来就没有更新图表工具，但如果需要基于相似风格的大量非常相似的图表，那么在时间上的投资也不错。它的能力比它看起来的要多。
• 使用 Illustrator 设置从 Excel 或任何研究人员使用的图表粘贴的样式- 大多数统计包可以导出为.eps或.svg- 然后设置矢量样式并更改文本以适应房屋样式。（请注意，删除 Excel 图表附带的剪贴蒙版有时会使线条和数据点略微移动）。
• 跟踪图表- 将其作为图像插入并在线条上重新绘制，然后在 Illustrator 中设置样式。我从来不需要这样做，但我听说这是学术出版中常见的必要邪恶。
• 使用基于代码的图表/布局工具，如 LaTeX 或 R 与 ggplot2 插件。我对这种方法知之甚少，但它很受分析而不是视觉头脑的人的欢迎，如果你有耐心，它能够获得专业的结果，并且结果非常一致，因为它设置了基于代码的模板。这是一篇文章，其中包含一些使用这种方法的示例 -为您的 R 图表设置样式，如经济学家、Tableau ... 或 XKCD
• 用 D3 之类的东西编写一个基于 Web 的图表，然后从 Web 浏览器中提取 SVG 输出，然后在 Illustrator 中打开它并在那里完成打印。纽约时报有时会这样做，我在另一个问题中讨论了这个以及如何获得准确的 CMYK 颜色。
• 使用自定义图表/可视化工具。一个流行的选项是Tableau，它可以生成非常专业的图表以及一些非常复杂的数据可视化。但是，它很昂贵，除非您的所有数据都可以免费公开获得，在这种情况下，您可以使用免费的Tableau Public。相当多的科学出版物使用 Tableau（我想不出名字）。WEAVE是一个开源替代品，但远没有那么漂亮（也不确定它输出什么，但如果它是 SVG，那么 Illustrator 可以编辑它），更多关于这类事情的信息。

Matlab和Mathematica是常用的分析工具，可以输出 2D 和 3D 图。

这里有一些讨论，表明这些工具确实是双头垄断。

在 Adob​​e Illustrator 中完成并不太复杂（尽管它可以尝试 --- 我发现使用 FreeHand 更快、更高效 --- 优雅）。

可以使用 Asymptote、Tikz、METAPOST 等工具，也可以使用 MatLab 或其他计算机代数/绘图工具创建它们。

我是一个大学团队的一员，以改进其他研究人员的情节。我们团队主要使用 Matlab 和 Illustrator。在某种程度上，Matlab 在显示绘图中的基本元素方面做得更好或更有效，包括添加轴标签、轴刻度、数据线和数据点。经过一些情节改进后，Illustrator 在改变情节元素的特征时效果更好。

我相信 Nature 中的团队（如果有的话）会做类似的过程。