一种用于可视化高维数据的预构建工具是ggobi。它可以让您为点着色以表示组，然后有一些选项可以将高维减少为二维表示。一个特别好的工具是 2D grand tour，它基本上可以在多个维度上旋转数据云，并向您展示旋转的 2D 投影动画。当您看到有趣的模式时，您可以减慢或暂停旋转。

你可以试试tSNE。使用起来非常简单。除了 Matlab 和 Python 之外，它还适用于 Octave。查看指南，在一分钟内获得第一个情节。

只是加我的 5 美分。python 库 Scikit-Learn 有很多算法：

http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/manifold/plot_compare_methods.html#example-manifold-plot-compare-methods-py

平行坐标图怎么样？

http://www.mathworks.com/help/stats/parallelcoords.html