lmer混合效应模型中的随机效应规范

机器算法验证 r lme4-nlme
2022-03-06 07:20:59

(1|DNA.concentration/mouse.id)和 和有什么不一样(DNA.concentration|mouse.id)随机效应的语法中 的符号|和含义是什么?/

1个回答

如果您有两个分类因子fg,则(1|f/g)扩展为(1|f) + (1|f:g),即 水平之间和水平之间(和 之间的交互作用)的截距变化条形左侧1这也称为嵌套在内部的随机效应(此处的顺序很重要)。这是在经典 ANOVA 模型中组合两个随机因素的传统方式,因为在该框架中,随机效应必须嵌套(即嵌套在 内嵌套在 内)。(见http://glmm.wikidot.com/faqff:gfgg ffggf有关嵌套因子的更多信息。)该模型估计两个参数,即,无论每个分类变量有多少级别。这将是嵌套设计的典型模型。σf2σf:g2

相反,(f|g)指定不同级别的影响例如,如果是具有“控制”和“治疗”级别的两级分类变量,则该模型指定我们允许截距(控制响应)和不同水平的治疗效果(控制和治疗反应之间的差异)变化每个效应都有自己的方差,默认情况下适合每个参数之间的协方差。该模型将估计参数,其中最后一个是指控制和治疗效果之间的协方差。如果fgfglme4σg,c2σg,t2σg,ctfn级别,该模型估计参数;它最适合随机区组设计,其中每个处理在每个区组中重复。n(n+1)/2

如果f有很多层次,后者 (f|g)) 模型规范可以暗示具有许多参数的模型;关于处理这种情况的最佳方法,正在进行一场辩论(参见例如这篇 ArXiv 论文)。

相反,如果我们考虑(x|g)wherex是一个连续(数字)输入变量,则该术语指定一个随机斜率模型;截距(隐式)和斜率在(也拟合了协方差项)的x水平上变化。g

在这种情况下,(g|x)没有任何意义 - 条形右侧的术语是一个分组变量,并且总是被解释为分类变量。唯一有意义的情况是设计x是连续的,但在每个级别都进行了多次观察,并且您希望将x其视为分类变量以进行建模。