期望值为 0 的卡方检验

机器算法验证 卡方检验
2022-03-24 01:26:08

我的列联表：

         heterozygous homozygous.minor homozygous.major
observed    2                 0               3
expected    0                 0               5

预期人群仅由 AA 基因型组成，但在观察到的人群中，我们观察到 2 个 AB 基因型。要为此计算卡方，我会忽略预期 = 0 的两种情况吗？所以我会这样做：

(3−5)2/5=0.8

2个回答

如果有某种原因（不是统计原因），您只会忽略 0；但包括它只会改变自由度，因为（0-0）当然是0。但是，我不确定你是否想要卡方。这取决于您为什么只期望 AA 基因型。

如果你确实想要卡方，那就是

(2−0)20+(3−5)25=∞

当细胞数较少时，卡方近似无效。尝试使用多项概率分布进行 Fisher 精确检验。

维基： https ://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%27s_exact_test

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