对具有树间和树内变化的设计的分析

机器算法验证 混合模式 生物统计学
2022-03-14 11:11:19

我正在计划一项实验,该实验涉及从五条街道(每条街道都是实验地点)的四棵树上采集昆虫。我的焦点树种有不同的雄性和雌性个体,植物性别是我想调查的一个因素,所以我的实验将对每种性别进行相同数量的采样。另外,我想研究昆虫在树内的分布,所以我将每棵树分成了两侧:一侧面向街道,另一侧背向街道。我的预期数据将如下所示:

Site  Tree  Sex  Side  Abundance
1     1     M    S     10
1     1     M    B     5
1     2     F    S     11
1     2     F    B     6
1     3     M    S     8
1     3     M    B     3
1     4     F    S     12
1     4     F    B     6

(对于列 Side,S 是面向街道的一侧,B 是背对街道的一侧。)

我目前计划的模型将性别和侧面作为固定效应(包括它们之间的相互作用),并将站点和树嵌套在站点内作为随机效应,即:

y~Sex*Side+(1|Site)+(1|Site:Tree)

但是,我不确定这一点,因为个体植物的性别不同(植物是雄性或雌性),而个体植物的侧面不同(每株植物都有两个侧面)。我需要什么样的模型来整合这些因素?

1个回答

您的型号:

y ~ Sex*Side + (1 | Site) + (1 | Site:Tree)

在概念上对我来说很有意义。然而,只有 5 个站点,这对于拟合随机截距来说是相当少的,所以我建议也拟合

y ~ Sex*Side + Site*Tree

希望 的推论SexSide它们的交互在两个模型中都是相似的。

你不需要任何特别的东西来解释内部和之间的因素。