汇集样本——有什么影响

机器算法验证 造型 实验设计 汇集
2022-04-07 01:39:36

有一个实验,其中采集生物样本进行多种处理和对照。对于每种处理,我们有足够的资源来评估 5 个样本。

一些研究人员建议(出于技术原因)对于每次处理,我们应该收集十个样本并将它们合并,这样我们就有五个池,每个池由两个混合在一起的生物样本组成。

我的主要兴趣是了解样本之间生物变异性背景下的处理效果大小,如果每个池将是两个生物样本的平均值,我认为这将丢失(或分析复杂)(还有其他原因不合并,主要是因为这些库与其他不合并的样本和测量值不兼容)。但是,由于技术原因,我们可能会被迫进行池化。

我的问题:

  1. 我们可以从池的方差中估计潜在的生物学方差吗?预期得到生物方差的估计值,对吗?σ22σ22
  2. 实验设计实际上有点复杂,它的分析将涉及建模组和随机效应(混合效应模型)。主要问题将是了解在人群(而不是池)背景下的治疗效果。是否可以将池合并到模型中?

为了详细说明第二个问题,我将举一个模型的具体例子。考虑如下随机块设计(我希望我做对了......):

Yij=β0+βjTj+ηiGi+ϵij

其中有处理的固定效应()和实验批次的随机效应()。我会使用 R 中的or库来分析它,应用混合效应模型。但是我很困惑如果样本被合并我会做什么。βjηinlmelmer

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