如何在高自然变异性下建立生态研究实验室

机器算法验证 方差分析 混合模式 实验设计 统计能力 自由程度
2022-04-08 03:41:24

我即将在土壤生态学和水文科学领域做一个实验室实验。在此之前,我想确保不会犯任何重大错误,因此我将不胜感激您的任何提示和评论。主要问题是如何处理高自然变异性 (~25%) 和相当小的样本量 (total max=20)。

实验的简短描述:

我们会将土芯放入圆柱体中,并将​​它们保存在不同的湿度情况下。大约一个月将测量三种不同类型的碳形式。
我们想知道变量是否在组内和组之间发生变化。

提出的试验设计如下:
将有2种不同的土壤类型,2种不同的处理+1个对照,每个处理应重复3次。因此,气缸总数为 18 个气缸。

一组内现场测量的变异性可高达 25%。由于实际原因,总共不能超过 20 个气缸。

我的问题:

  1. 只有一种治疗和一种对照,但每一种都重复五次是否更有意义?
  2. 在这些条件下,我能从这种实验中得出任何可靠的结论吗?
  3. 我应该如何设置参数以使用例如G*Power 3进行一些功率计算?我应该选择哪个测试?我应该将效果大小设置为什么以及 df 的数字应该是什么?
  4. 实验完成后我应该如何分析数据?我应该使用方差分析吗?我可以使用混合效应模型吗?
1个回答

您是否有合理的机会获得(即获得)可靠结论取决于您希望能够检测到多大的影响。由于数量如此之少,它们必须非常大。显然,更少的治疗和更多的重复每次治疗至少会给你更多的力量,或者等效地,用相同的力量检测更小的效果的能力。

为了给出一些粗略的数字,为了简单起见,让我们忽略土壤类型(包括它们会使事情变得更加悲观),并为 2 样本 t 检验进行一些标准的两样本功效计算。如果您将一种治疗与对照与每组中的 10 种(即总共 20 种)进行比较,您将有 80% 的功效来检测治疗与对照之间 1.25 个标准差 (SD) 的差异。使用两种治疗 + 对照,每组 6 个(总共 18 个),您有 80% 的功效来检测两种治疗组合和对照之间 1.4 SD 的差异,或两者之间 1.6 SD 的差异单独治疗和对照(或在两种治疗之间)。在分析之前使用对数变换(或其他一些变换)您的数据可能是明智的,在这种情况下,SD 是转换后变量的 SD。

社会科学中,大约 0.8 SD 或以上的影响通常被认为是“大”的,并且设计一项研究以检测到具有不错的能力,只是为了检测到比这更大的影响可能被礼貌地描述为“乐观”。但请记住,这里的 SD 是残留的、无法解释的变化的 SD。您可以通过 (1) 使您的实验单元更统一或 (2) 通过其他方式解释更多变化来减少这种情况。

  1. 由于对实验操作开放的因素,不受控制的可变性越低,您检测效果的能力就越高。您说“一组内现场测量的变异性可能高达 25%”。但这是一个实验室实验;实验室的变异性需要这么高是否有原因?在开始实验之前,您可以将土壤均质化吗?我想这可能会破坏土壤结构?

  2. 您可以在应用治疗之前进行基线测量吗?通过分析自基线以来的变化或(更好地)将它们作为协变量(例如 ANCOVA)添加到模型中,使用这些来解释单位之间的一些固有可变性可能会有很大帮助。

抱歉,我没有提到 G*Power 3,但我从未听说过它,快速浏览一下,您提供的链接看起来比这里需要的要复杂得多,因此也很复杂。