您正在寻找这篇JCP 文章的C 部分。我看到你隶属于一所大学，所以你应该能够访问它。他们似乎正在为气液界面执行此操作，因此您显然希望根据您正在研究的材料以某种晶格配置开始固体部分（在您的情况下）并相应地进行模拟。

请让我知道这篇文章是否包含您正在寻找的内容，因为我开始编写自己的分子动力学包（旨在模拟量子流体的路径积分分子动力学）但不得不放下它以继续我的论文研究暂时。

你在研究什么系统？以及在什么物理条件下（温度、密度等）。这可能会影响这个问题的答案，也可能决定您需要使用哪种分子动力学模拟。

编辑：

试试这个出版物。我只阅读了摘要，因此我不确定它是否会明确地向您展示如何使用 MD 进行操作，但从摘要中，它声称提供了一种测量平面固体表面和液体之间的表面张力的方法。