检测 MR 图像中的结构(血管)

计算科学 计算生物学
2021-11-29 12:54:14

我所拥有的是大脑的 3D 灰度图像,其中暗像素表示血管(见下文,红色箭头标记血管)。目的是获得一些关于它们的描述性统计数据,例如大脑中的血管数量或血管占据的大脑体积分数。目前,一些穷学生要么手动计算大脑中的所有血管,要么我们只看一定体积的直方图,以确定血管的体积分数。

这是一个普遍的问题,但是您会采取什么方法来自动检测这些结构?Scikit 图像似乎有一些很有前途的边缘检测方法。该算法应该适用于 3D 矩阵,因为一个血管可以跨越多个图像切片。灰度值也可用于提高分辨率:完全被血管填充的体素具有最低的信号值,而仅部分被血管占据的体素具有稍高的信号值。

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