我试图在 Gaussian 09（和 gaussView）中使用半经验方法优化 CdSe（半胱氨酸）分子，以进行量子点的初步研究。但似乎随着迭代次数的增加，得到的优化分子正在解离成与其他片段没有直接键/连接的不同亚组。有什么办法可以解决这个问题吗？
Thi是初始分子和优化的分子构象之一。
高斯几何优化：分子被分解成子组？
计算科学
优化
几何学
密度泛函理论
2021-12-02 04:19:15
1个回答
我不完全明白问题出在哪里。债券应该在哪里，S-Se 债券？像这样，这些距离似乎并不比 Cd-S 长多少。
在任何情况下，您都不应该被视觉表示中连接原子的“棒”所困扰：有阈值告诉程序何时显示它们，何时不显示它们。实际上，在 GaussView 中，您可以在想要的原子之间添加棒，即使它们的距离为 10 Ang。此外，如果您使用的是量子力学方法（即使是半经验的），则棍子根本没有任何意义，因为它们只是您的代表。
你应该检查的是：
- 实际的 Se-S 距离，以及它与文献值的比较。
- 优化是否正确进行，是否在相同结构之间振荡。
- 如果 1 不令人满意，可能会提高理论水平。
- 如果是 3，请为金属使用合适的基组，因为“常规”基组可能无法很好地描述它。
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