我发现了一些分布,其中 BUGS 和 R 具有不同的参数化:Normal、log-Normal 和 Weibull。
对于其中的每一个,我认为 R 使用的第二个参数需要在用于 BUGS(或在我的情况下为 JAGS)之前进行逆变换(1/参数)。
有谁知道当前存在的这些转换的完整列表?
我能找到的最接近的是将JAGS 2.2.0 用户手册的表 7 中的分布与等的结果进行比较?rnorm
,也许还有一些概率文本。这种方法似乎要求需要分别从 pdf 中推断出转换。
如果它已经完成,我宁愿避免这个任务(和可能的错误),或者从这里开始列表。
更新
根据 Ben 的建议,我编写了以下函数来将参数数据帧从 R 转换为 BUGS 参数化。
##' convert R parameterizations to BUGS paramaterizations
##'
##' R and BUGS have different parameterizations for some distributions.
##' This function transforms the distributions from R defaults to BUGS
##' defaults. BUGS is an implementation of the BUGS language, and these
##' transformations are expected to work for bugs.
##' @param priors data.frame with colnames c('distn', 'parama', 'paramb')
##' @return priors with jags parameterizations
##' @author David LeBauer
r2bugs.distributions <- function(priors) {
norm <- priors$distn %in% 'norm'
lnorm <- priors$distn %in% 'lnorm'
weib <- priors$distn %in% 'weibull'
bin <- priors$distn %in% 'binom'
## Convert sd to precision for norm & lnorm
priors$paramb[norm | lnorm] <- 1/priors$paramb[norm | lnorm]^2
## Convert R parameter b to JAGS parameter lambda by l = (1/b)^a
priors$paramb[weib] <- 1 / priors$paramb[weib]^priors$parama[weib]
## Reverse parameter order for binomial
priors[bin, c('parama', 'paramb')] <- priors[bin, c('parama', 'paramb')]
## Translate distribution names
priors$distn <- gsub('weibull', 'weib',
gsub('binom', 'bin',
gsub('chisq', 'chisqr',
gsub('nbinom', 'negbin',
as.vector(priors$distn)))))
return(priors)
}
##' @examples
##' priors <- data.frame(distn = c('weibull', 'lnorm', 'norm', 'gamma'),
##' parama = c(1, 1, 1, 1),
##' paramb = c(2, 2, 2, 2))
##' r2bugs.distributions(priors)