我有一个具有二项分布和 logit 链接函数的 GLMM,我觉得数据的一个重要方面在模型中没有很好地表示。
为了测试这一点,我想知道数据是否可以通过 logit 尺度上的线性函数很好地描述。因此,我想知道残差是否表现良好。但是,我无法找出要绘制的残差图以及如何解释该图。
请注意,我使用的是新版本的 lme4(来自 GitHub 的开发版本):
packageVersion("lme4")
## [1] ‘1.1.0’
我的问题是:如何检查和解释具有 logit 链接函数的二项式广义线性混合模型的残差?
以下数据仅代表我真实数据的 17%,但在我的机器上拟合已经需要大约 30 秒,所以我将其保留为:
require(lme4)
options(contrasts=c('contr.sum', 'contr.poly'))
dat <- read.table("http://pastebin.com/raw.php?i=vRy66Bif")
dat$V1 <- factor(dat$V1)
m1 <- glmer(true ~ distance*(consequent+direction+dist)^2 + (direction+dist|V1), dat, family = binomial)
最简单的绘图 ( ?plot.merMod
) 产生以下结果:
plot(m1)
这是否已经告诉我一些事情?