我想使用 Fisher 精确或 G 检验/卡方(选择取决于特定情况下的观察次数)来测试重复的观察组之间和内部的物种频率差异。这是一些玩具数据
1.1 1.2 1.3 2.1 2.2 2.3
spec1 1 2 1 3 5 4
spec2 4 4 6 0 1 1
spec3 10 12 9 9 10 10
第一行表示样本。样品 ID 的第一个数字代表一个重复组,第二个数字代表一个重复。这是为第一个物种折叠的数据集的示例。
spec1 1 2 1 3 5 4
others 14 16 15 9 11 11
比较组内的重复很容易,因为我们可以简单地执行一堆成对测试并应用一些多重比较 p 值调整,但是当我们比较不同组时如何处理重复呢?我们可以将它们组合成一个样本吗?
我知道这篇文章,但它没有答案。