我是分子动力学 (MD) 模拟的新手。就模拟时间而言，分子动力学模拟的复杂性是多少？换句话说，如果我想将模拟时间从 10 纳秒增加到 20 纳秒，那么在运行时间的增加方面我可以期待什么？
MD 模拟的复杂性
计算科学
分子动力学
复杂
2021-11-27 23:53:29
1个回答
分子动力学模拟O(n)在模拟的时间长度上是线性的（ ）（假设单个时间步（) 不变)。由于每个时间步仅取决于先前的配置（而不是之前的任何配置），因此增加时间步数会导致时间线性增加。
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