不对称结构的模拟(占用率 = 0.5)不稳定

计算科学 稳定 分子动力学
2021-12-05 04:36:06

我正在尝试使用 UFF 电位在 LAMMPS 中模拟金属有机框架。对于所有分子占用率为 1 的某些结构,它工作得很好。

但是,当我有一个占有率为 0.5 的溶剂分子时,我所做的是为每个晶胞随机选择两个位置之一。结构在模拟时坍塌。我不知道如何解决这个问题。我的 MOF 大约是 6x3x3 单元格大;尝试一个庞大的系统是否有任何有益的理由?

我也试过在低温下模拟,NPT,NVT;它每次都分崩离析。你真的不应该对 UFF 使用部分费用,但我尝试过使用和不使用。

令我惊讶的是,一个结构如此稳定,然后一个略有不同的结构却有 0.5 个入住率分崩离析。有人对这个有经验么?

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