我正在尝试使用 UFF 电位在 LAMMPS 中模拟金属有机框架。对于所有分子占用率为 1 的某些结构,它工作得很好。
但是,当我有一个占有率为 0.5 的溶剂分子时,我所做的是为每个晶胞随机选择两个位置之一。结构在模拟时坍塌。我不知道如何解决这个问题。我的 MOF 大约是 6x3x3 单元格大;尝试一个庞大的系统是否有任何有益的理由?
我也试过在低温下模拟,NPT,NVT;它每次都分崩离析。你真的不应该对 UFF 使用部分费用,但我尝试过使用和不使用。
令我惊讶的是,一个结构如此稳定,然后一个略有不同的结构却有 0.5 个入住率分崩离析。有人对这个有经验么?