我目前正在估计由几个常微分方程 (ODE) 定义的模型的参数。我通过使用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)在给定一些数据的情况下近似参数的后验分布来尝试使用贝叶斯方法。
MCMC 采样器生成一个参数值链,其中它使用某个参数值的(未归一化的)后验概率来(随机地)决定是将该值添加到链中还是再次添加先前的值。但是,似乎不需要保存实际的后验概率,而是生成结果参数值的 n 维直方图,并计算参数后验分布的最高密度区域 (HDR) 等汇总统计数据从这个直方图中。至少这是我认为我从Kruschkes 关于贝叶斯推理的教程书中学到的。
我的问题:将采样参数值的后验概率与这些一起保存并从这些值而不是从 MCMC 链中参数值的频率近似后验分布不是更直接吗?老化阶段的问题不会出现,因为采样器最初仍然会更频繁地对低概率区域进行采样,而不是它们“应得”的后验概率,但不再是给这些区域提供过高概率值的问题。