您可以假设任何简单的模型,没有碰撞/吸引力、分子直径为 0 和完美混合。
如果每 micro-m^3 分子 A 有 500 个拷贝,则每个分子 A 都有一个 125 nm x 125 nm x 125 nm 的盒子。然而,根据我的直觉,与最近邻居的预期距离应该明显小于 125 nm,因为理论体积的形状不会是完美的立方/球形。
所以我的问题是:
- 分子 A(到最近的分子 A)之间的预期距离是多少?
背景 根据这个来源,我们在人类细胞中每微 m^3 有 1^6 种蛋白质。如果我们假设有 20.000 个基因,并且我的蛋白质比平均基因(可能根本不表达)多表达约 10 倍,那么这将是每微 m^3 500 个拷贝。
编辑:我问错了问题
实际上,我需要知道 1 个 RNA 与立方微米内最接近的 500 个蛋白质之间的预期距离(中心到中心,没有勾结)。我做了一个小的 3d 随机游走模拟,但结果与@whuber 结果完全不同。我想知道原因是稍微不同的问题还是我的模拟不准确。