机器算法验证 - 是什么 ”R2R2" R 中 coxph 模型摘要中给出的值 - 吾爱随笔录

机器算法验证 r 生存 r平方 cox模型

2022-01-22 11:40:11

是什么 $R^2$ R中的coxph模型摘要中给出的值？例如，

Rsquare= 0.186   (max possible= 0.991 )

我愚蠢地把它写成了手稿 $R^2$ 价值和评论者跳上它说他不知道类似物 $R^2$ 来自为 Cox 模型开发的经典线性回归的统计数据，如果有，请提供参考。任何帮助都会很棒！

2个回答

使用getS3method("summary","coxph")您可以查看它是如何计算的。

相关代码行如下：

logtest <- -2 * (cox$loglik[1] - cox$loglik[2])
rval$rsq <- c(rsq = 1 - exp(-logtest/cox$n), maxrsq = 1 - 
        exp(2 * cox$loglik[1]/cox$n))

这里cox$loglik是“一个长度为 2 的向量，其中包含具有初始值和系数最终值的对数似然”（参见参考资料?coxph.object），并且cox$n是“拟合中使用的观察次数”。

除以 $n$ 总结中的观察次数coxph是错误的，应该是未经审查的事件数；参见 O'Quigley 等人。（2005 年）解释了比例风险模型中的随机性医学统计 p。479-489。

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